В 1825 году будущий король Баварии Людвиг I приобрел за счет частных средств картины молодых художников, стремившихся к обновлению искусства. «Святое семейство» (1818) Фридриха Вильгельма фон Шадова, «Портрет маркизы Марианны Флорентийской» (1824) Генриха Марии фон Гесса и «Италия и Германия» (1832) Иоганна Фридриха Овербека образовали ядро быстро растущей коллекции современной живописи. В 1853 году напротив Старой пинакотеки открылась Новая.
Это первый музей, в котором нашли свое место работы европейских художников от эпохи Просвещения до начала XX века – от Гойи и Давида до Ван Гога и Сезанна. В 1944 году здание Новой пинакотеки серьезно пострадало в ходе авианалетов. После войны некоторые произведения были временно выставлены в мюнхенском Доме искусств. Потребовались десятилетия, чтобы коллекция произведений современного искусства снова стала доступна для осмотра. В 1981 году Новая пинакотека обрела постоянное здание. Помимо картин в ней представлена и скульптура.