В 1294 году герцог Альберт II дал разрешение основать доминиканский монастырь на берегу Ляйнского канала. Строительство готической церкви Св. Петра и Павла на этом месте завершилось в 1331 году. Через десять лет монастырь стал обладателем мощей св. Фомы Аквинского, привлекавших многочисленных паломников. В 1529 году в церкви Св. Петра и Павла состоялась первая в истории Гёттингена протестантская служба. В 1812 году здание перешло под контроль Гёттингенского университета. Сейчас университетская библиотека, одна из крупнейших в Германии, использует здание церкви для проведения лекций и выставок на исторические темы.