Собор святого Фомы считается вторым по значимости собором Лейпцига. Церковь была построена на Рыночной площади города в первой половине XIII века. По легенде, здесь хранятся мощи апостола Фомы, которые якобы вывез из Индии знатный паломник Генрих фон Морунген.
Морунген, слывший поэтом-миннезингером, считается основателем хора мальчиков, который действует при церкви с момента ее основания. С тех пор и до сегодняшнего дня около сотни мальчиков исполняют в храме духовные оратории удивительной красоты. В XVIII столетии, на протяжении 27 лет, дирижером хора (Thomanerchor) был великий Иоганн Себастьян Бах. Теперь у входа в церковь есть памятник Баху, а в 1949 году рядом были перезахоронены и останки великого музыканта.
Храм святого Фомы знаменит и тем, что в его стенах в 1539 году, в день святой Троицы, отслужил мессу реформатор церкви Мартин Лютер. Служба прошла тогда по новому, реформистскому обряду.