Историко-архитектурный музей под открытым небом появился в нескольких километрах от новосибирского Академгородка благодаря научной экспедиции. В 1969 году группа учёных под руководством Баландина обнаружила в заброшенном селе Зашиверске на севере Якутии деревянную церковь Спаса Нерукотворного образа 1700 года. Когда стали выяснять её историю, стало известно, что казаки, торговавшие пушниной, основали поселение на берегу реки Индигирки в 1639 году, но к середине XIX века оно опустело. В 1970 году учёные вручную разобрали церковь и привезли её в Новосибирск.
Уникальная по степени сохранности церковь и стала первым экспонатом историко-архитектурного музея под открытым небом. Он открылся в 1981 году, когда у него появилась собственная территория. Сегодня на ней можно увидеть башни Казымского острога XVIII века, крестьянское подворье с ветряной мельницей и баней «по-чёрному» (с открытым очагом). Помимо русского зодчества тут представлены родовое святилище народа манси и бурятская юрта. Есть и коллекция каменных скульптур, часть из которых относятся к эпохе палеолита. В отдельной зоне собраны инструменты древних охотников. Экскурсии по музею проводятся только в тёплое время года: с июня по конец сентября.