Морской аквариум-музей был основан в Севастополе в 1897 году по инициативе академика Ковалевского на базе биологической станции. Сотрудники станции читали здесь в то время лекции о жизни обитателей Чёрного моря. На сегодняшний день это старейший аквариум в России! Любопытно, что в конце XIX века посетить его можно было бесплатно.
В 1994 году экспозицию морского аквариума-музея расширили. Хотя он всё равно остался небольшим и уютным. В пяти его залах можно увидеть не только тех, кто живёт в Чёрном море, но и представителей коралловых рифов, тропических вод, черепах и рептилий (питонов, игуана). Кроме них, тут есть и опасные для человека морские рыбы: акулы, электрический угорь, пиранья, рыба-камень, мурена, рыба фугу.