История Спасо-Яковлевского монастыря — это путь от скромной обители до одного из самых важных в регионе объектов паломничества. Здесь хранятся мощи Димитрия Ростовского — митрополита Ростовского и Ярославского, святого, которого особенно чтила царская семья. В монастыре побывали все русские цари из рода Романовых.
В середине XIII века на берегу озера Неро располагалась женская обитель. В 1389 году рядом с ней был основан мужской Спасо-Яковлевский монастырь. Своим появлением он обязан епископу Ростовскому Иакову: тот построил здесь деревянную церковь, а обитель назвал Зачатьевской. После его смерти её переименовали в Яковлевскую. К концу XVII века в монастыре деревянный храм перестроили в каменный пятиглавый Зачатьевский собор. Он был расписан ярославскими мастерами. С 1702 по 1709 год обитель опекал ростовский митрополит Дмитрий Ростовский. Он похоронен в Зачатьевском соборе, на месте, которое он сам указал. Храм Димитрия Ростовского строился на деньги известного мецената графа Николая Шереметева. Это однокупольная церковь, с многоколонными портиками и барельефами на фасаде и лепниной в интерьере. Отдельно стоит трёхъярусная колокольня.
Возрождение монастыря после советского периода состоялось в 1991 году. В нём и сейчас можно поклониться мощам святого Димитрия. В 1996 году в обители была построена часовня святого Якова: она находится возле целебного источника.