Самый посещаемый музей Германии изначально создавался для хранения алтаря, обнаруженного в Пергаме (современная Турция) немецким археологом Карлом Хуманом в 80-е годы XIX века. Каменный жертвенник древние мастера, жившие во II веке до н.э., посвятили Зевсу и Афине.
Для хранения алтаря в 1910–1930 годах было возведено здание в неоклассическом стиле. В дальнейшем в нем были размещены и другие находки, привезенные из археологических экспедиций. Ворота Иштар 575 г. до н.э. когда-то находились в северной части Вавилона. От них шла Дорога процессий, по обе стороны которой возвышались стены, оформленные с помощью глазурованной мозаики. Фрагменты этого украшения теперь тоже можно увидеть в Пергамском музее.
Рыночные ворота из Милета II века – шедевр римской архитектуры. Стоит обратить внимание и на фриз дворца из Мшатты VIII века, найденный в Иордании. В настоящее время в музее три раздела: античное собрание, исламское искусство и Передняя Азия. После реконструкции, которая продлится до 2019 года, планируется открыть четвертый корпус. В нем будут размещены экспонаты из запасников.