Йена известна с 1145 года, правда статус города она обрела лишь сто лет спустя, получив соответствующие права. В средневековье жизнь города фактически зависела от успешной коммерческой деятельности трех монастырей, расположенных здесь. Монахи в монастырях занимались виноделием, что обеспечивало стабильный приток денег в городскую казну. Город трех монастырей активно принял Реформацию, что стало результатом деятельности Мартина Лютера, которая проходила как раз в этих краях. Сам Лютер неоднократно бывал в Йене. Он читал здесь проповеди с амвона собора святого Михаила. До сих пор одной из городских достопримечательностей является гостиница «Черный медведь» (Schwarzer Bär), в которой Лютер останавливался во время визитов в Йену.
В 1548 году в Йене был основан университет. Постепенно он стал ядром города, притягивающим интеллектуалов со всей Европы. Особенной популярностью он пользовался у поклонников философского течения идеализма. В конце XVIII столетия в его стенах преподавали такие столпы идеализма, как Иоганн Фихте, Фридрих Шеллинг, Георг Гегель. Тогда же здесь работали великие немецкие поэты-романтики: Фридрих Шиллинг, Новалис, Людвиг Тик, братья Шлегели. Бывал в университете и Гёте. Чуть позже именно в Йенском университете защищал кандидатскую диссертацию Карл Маркс.
В 1806 году произошло одно из наиболее заметных событий Наполеоновских войн – битва при Йене. Император Франции разгромил прусские войска. Парадоксальным образом, вскоре Йена стала одним из духовных центров объединения немецкой нации. Здесь сохранился исторический дом Grüne Tanne. В начале ХIX века его занимал Студенческий союз, образованный студентами, недавно воевавшими в добровольческом прусском батальоне майора фон Лютцова. Мундиры у ополченцев были желто-красно-черных цветов. Этот же триколор они избрали в качестве своего флага. Спустя сто лет желто-красно-черный стяг стал флагом Веймарской Германии, а по окончании Второй мировой войны был хоть и с некоторыми различиями, но принят и ФРГ, и ГДР. Теперь это снова флаг единой Германии, и родиной его считается именно Йена.
Йена считается первопроходцем в деле организации акушерской помощи немецким женщинам. Именно в этом городе в 1778 году появился первый на территории Германии родильный дом. Назывался он «Дом Акушерок». Аутентичное здание до наших дней не сохранилось. Но дом, стоящий на месте первого акушерского дома, украшает мемориальная табличка. Во второй половине XIX века Йена стала центром немецкой оптики и точного машиностроения. Промышленники Карл Цейсс, Эрнст Аббе и Отто Шотт создали в городе компании, которые со временем стали известны под брендом Карл Цейсс. «Цейссовские» линзы надолго стали синонимом высочайшего качества шлифовки. В XX веке концерн внес лепту в облик города: в центре появилась 159-метровая Йенская башня (Jentower) - вторая по высоте башня на территории ГДР. Карл Цейсс выстроил ее для своего научно-исследовательского центра.
В Йене интересно побывать в церкви святого Михаила (Stadtkirche St. Michael), где проповедовал Лютер, походить по музею оптики и в планетарии, которые патронируются концерном «Карл Цейсс», заглянуть в дом-музей Шиллера (Schiller Haus), посмотреть на старую Ратушу с астрономическими часами и «Хватающим Гансом», забраться на Йенскую башню.
Походив по наиболее значимым местам Йены, следует отдать должное и местной гастрономии. Рестораны Йены предлагают лучшие блюда традиционной тюрингской кухни. А кухня эта, известная как «зеленое сердце Германии», отличается большим числом блюд из овощей и фруктов. Повара широко используют капусту, брокколи, огурцы, лук, горох, чеснок, спаржу. Очень распространены соусы и подливы из грибов. Любители мясных блюд оценят тюрингские сосиски (Thüringer Bratwurst), которые составляют конкуренцию знаменитым баварским колбаскам. Подаются они с овощным гарниром: картофельными клёцками (Thüringer Klöße) или яблочными или картофельными макаронами (Schleizer Bambser). Еще одно фирменное местное блюдо - Rinderrouladen - говяжий рулет, который принято подавать с круглым вареным картофелем и шариками цветной капусты. Главный салат Тюрингии - картофельный (Kartoffelsalat). Основной пирог, подающийся в Йене - луковый (Zwiebelkuchen). Фирменный десерт Тюрингии - Blechkuchen - сухие пирожные с ягодной начинкой. Кстати, цены на блюда в ресторанах Йены приятно удивят посетителей. Всё-таки это небольшой университетский городок и масштабу цен здесь далеко до столичного размаха.